COVID-19 パンデミック時に、国家プログラムが SARS-CoV-2 検査のために PEPFAR がサポートする検査室リソースをどのように活用したか

Study: Contribution of PEPFAR-Supported HIV and TB Molecular Diagnostic Networks to COVID-19 Testing Preparedness in 16 Countries. Image Credit: tilialucida/Shutterstock


Emerging Infectious Diseases に掲載された最近の研究で、研究者は国家レベルのプログラムが PEPFAR を活用する方法を説明しました。 [president’s emergency plan for acquired immunodeficiency syndrome (AIDS) relief]- コロナウイルス病 2019 (COVID-19) 中の重症急性呼吸器症候群コロナウイルス 2 (SARS-CoV-2) テストのための実験室ベースのリソースを支援しました。

調査: PEPFAR がサポートする HIV および TB 分子診断ネットワークが 16 か国の COVID-19 検査準備に貢献。 画像著作権: tilialucida/Shutterstock

バックグラウンド

米国 (US) PEPFAR は、分子性ヒト免疫不全ウイルス (HIV) および結核 (TB) の診断ネットワークと、LMICs (低中所得国) 間のデータ管理システムを支援します。 SARS-CoV-2 検査アッセイが利用可能になったことで、PEPFAR 支援の LMIC は、既存の検査室のセットアップ、人的資源、報告、機器、紹介、サプライ チェーンを利用してカスタマイズされた検査戦略を開発し、COVID-19 検査のために標準化されました。

各国が COVID-19 のテストに使用した戦略は独自のものでした。 彼らは、SARS-CoV-2検査の既存の能力と、大規模な検査能力を備えた効率的な集中型検査室のセットアップまたはCOVIDのポイントの近くに位置する低効率の分散型検査室のセットアップを利用する国々の検査ニーズとの間でバランスをとる必要がありました。 19 患者ケア。

研究について

現在の横断的かつレトロスペクティブな研究では、研究者は、SARS-CoV-2 パンデミックの際に使用された、既存の PEPFAR 支援集団保健研究所を定量化しました。

チームは、2020 年 4 月 1 日から 2021 年 3 月 31 日までの SARS-CoV-2 発生時の PEPFAR 支援分子診断ネットワークの使用を評価する 46 の指標を含む Microsoft Excel スプレッドシートを、27 の PEPFAR 支援地域または国に送信しました。 スプレッドシートは、アジア、アメリカ、アフリカの 24 か国と 3 地域の CDC (疾病管理予防センター) PEPFAR 研究所アドバイザーにも、公開要求として電子的に送信されました。

大まかに、次の 3 つのカテゴリが特定説(推定)されました。 (ii) COVID-19 データを管理するための PEPFAR 支援の検査室情報システム (LIS)。 (iii) COVID-19 検査のための分散型 HIV および結核リソースと機器。 データは、2021 年 6 月から 8 月の間に CDC の国内研究所アドバイザーから取得され、続いてジョージア州の CDC 本部のスタッフによって検証されました。

全国レベルの COVID-19 テスト ボリュームは、Our World in Data データベースから取得しました。 中央研究所は、通常の EID および HIV 検査に利用される効率的な検査プラットフォームを備えたものであり、COVID-19 検査に利用できます。 分散検査室は、HIV および/または結核検査のために PEPFAR によって支援された任意の生成容量の機器を備えた検査室でした。

チームは、PEPFAR が支援する分散化および集中化された研究所の数に関する国固有の情報を入手しました。 COVID-19 検査に関与する研究所。 実験装置; 結核、HIV、COVID-19、および EID の臨床検査量。 PEPFAR が支援する要員の使用、検査室の報告、トレーニング、LIS、および検査室の 2 つのレベルでの COVID-19 検査のための備品。

結果

合計で、アクティブな COVID-19 検査は、PEPFAR が支援する 109 の集中型 HIV EID および VL 検査ラボと、16 か国にある 138 の分散型ラボで記録されました。 (´・ω・`)ると、検査地域は 12 か月で 300 万件を超える COVID-19 検査に貢献しました。

2020 年 3 月から 12 月の間に 11 か国が、121 の分散型および集中型研究所で COVID-19 検査を管理するために PEPFAR 支援 LIS を実装し、11 か国すべてが代表 LIS が SARS-CoV-2 サーベイランスに貢献したことを文書化しました。 11か国の中で、報告期間中に3,341,592件のCOVID-19検査が実施され、全国の検査量の42.0%を占めました。

ドミニカ共和国、エチオピア、ザンビアでは、PEPFAR が支援する研究所で 500,000 件を超える COVID-19 検査が実施され、全国の検査量のそれぞれ 50%、27%、49% を占めています。 さらに、3 カ国は、96% (ドミニカ共和国) から 37% (ザンビア) の範囲の HIV EID および VL 検査と比較して、PEPFAR 支援の中央研究所で実施された COVID-19 検査の最大数を文書化しました。

モザンビーク、ケニア、ナイジェリア、ウガンダでは 208,000 ~ 402,000 件の COVID-19 検査が実施され、それぞれ全国の COVID-19 検査量の 80%、70%、30%、33% を占めています。 16カ国のうち、14カ国、13カ国、12カ国、10カ国が、COVID-19の検査に、それぞれPEPFARが支援する検査報告書、人員、照会ネットワーク、トレーニング資料を使用しました。

11 か国が SARS-CoV-2 を HIV および結核の診断サービスに統合し、PEPFAR が支援する 138 の分散型サイトを横断しました。 特に、2020 年 6 月以前に分散型 COVID-19 テストを実施した国はありません。南スーダン (100%)、ドミニカ共和国 (64%)、マラウイ (39%)、コンゴ民主共和国 (11%)、ジンバブエ(27%) は、COVID-19 検査のための PEPFAR 支援の分散型検査機器の使用の大部分を記録しました。

GeneXpert の使用率が低いことは、ザンビア、ナイジェリア、ウガンダ、エチオピア (250 から 400 の機器) など、大規模なネットワークをサポートしている国で記録されています。 ほとんどの COVID-19 検査は、ナイジェリア、ザンビア、レソト、マラウイ、モザンビーク、ジンバブエで記録されましたが、COVID-19 検査の量は、エスワティニとドミニカ共和国で最も少なくなっています。

PEPFAR が支援する分散型リージョンは、計測器の効率が低いため、テスト ボリュームの 2.5% しか貢献しませんでした。 COVID-19 検査用品は 8 か国に提供されました。 さらに、7 か国が PEPFAR 支援の診断接続ソリューションを使用して、COVID-19 検査結果を監視プログラムまたは医療提供者に報告しました。

結論

全体として、調査結果は、PEPFAR 支援診断ネットワークが COVID-19 診断テストのための膨大なリソースを 16 の LMIC に提供したことを示しました。



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