米国居住者のSARS-CoV-2感染率は?

Study: Differential contagiousness of respiratory disease across the United States. Image Credit: Evgenia.B/Shutterstock


medRxiv* プレプリント サーバーに投稿された最近の研究では、研究者は再現された重症急性症候群コロナウイルス 2 ( SARS-CoV-2) 監視データ。

研究: 全米の呼吸器疾患の伝染性の違い。 画像著作権: Evgenia.B/Shutterstock

米国でのコロナウイルス病 2019 (COVID-19) の監視活動は、国内の SARS-CoV-2 感染力学に関する貴重な洞察を提供しました。 SARS-CoV-2 パンデミックの開始時に、複数の米国地域が単一の病原性ウイルス (SARS-CoV-2) の影響を同時に受けました。 したがって、地域ごとの COVID-19 R0 推定値を比較することで、SARS-CoV-2 感受性の違いを判断するために、さまざまな地域の人口特性がどのように融合するかを解明できます。

特定説(推定)の集団における伝染病の原因となる病原体の最初の感染は、R0 値に基づいて定量化できます。原因病原体と集団。 本研究の著者は以前、最も人口の多い 15 の米国 MSA と米国の 50 州すべてについて、毎日の SARS-CoV-2 感染症例数データを再現できるコンパートメント分析モデルを開発しました。

研究について

本研究では、研究者は以前に開発されたモデルを使用して、384 の米国の MSA のうち 280 の地域の COVID-19 R0 推定値を推定しました。これは、都市部に住む米国の人口の 95% と総人口の 82% を占めています。

分析にはコンパートメントモデルベースのアプローチが使用されましたが、そのためには均一な母集団が必要です。 SARS-CoV-2 感染が米国 MSA 郡または州全体でより均一に発生するかどうかを確認するために、3 つの変動尺度 (ジニ係数、ワッサースタイン-1 距離、およびファノ係数) を使用して、1 週間あたりの COVID-19 発生率の変動性を評価しました (つまり、 、7日間にわたるSARS-CoV-2感染のリスク)。

コンパートメントモデルは、NPI(非医薬品介入)/社会的距離の初期期間を考慮し、その間に個人の割合が病気を回避する行動を採用しました. 対照的に、残りの個人は、COVID-19 予防のための予防措置を講じることなく、自由に社会活動に従事していました。

3 つの変動性測定値は、選択された MSA と重複する州の疫学的週の関数としてプロットされました。 複数郡の MSA および州の時間平均変動測定のヒストグラムが分析されました。 すべての MSA について、MCMC (マルコフ連鎖モンテカルロ) サンプリング手順によって有効になったベイジアン推論アプローチを適用して、最尤推定値に相当する最大事後 (MAP) R0 推定値を導き出しました。

2020 年 1 月 26 日から 2020 年 12 月 26 日までの期間に対応する疫学的な第 5 週から第 52 週の変動性測定値は、MSA および複数の郡で構成される 50 の州について、1 日あたりの確認された SARS-CoV-2 感染の毎日のカウントを統合することによって計算されました。郡レベル。 変動性評価のために、ニューヨーク タイムズが管理する GitHub パブリック リポジトリからデータを取得しました。

結果

郡の数が最も多いと特定説(推定)された MSA は、アトランタ (n=29 郡)、ワシントン (n=25 郡または郡と同等)、ニューヨーク市 (NYC、n=23 郡または郡と同等)、バージニア ビーチ (n=19) でした。郡または同等の郡)。 R0 推定値は、SARS-CoV-2 感染に対する地域ごとの相対的な感受性について、1.9 (ウィスコンシン州アップルトンを含む MSA の場合) から 7.7 (ミシガン州デトロイトを含む MSA の場合) の範囲でした。

異なるR0推定値は、SARS-CoV-2の初期拡散に寄与する集団の特徴が地理的に不均一であり、組み合わされてSARS-CoV-2の> 4倍の伝染性をもたらすことを示しました。 変動性測定値は、重複する状態の測定値と比較して、MSA の方が小さかった。

3つの変動性測定すべてについて、MSAヒストグラムは州のヒストグラムと比較して左側のシフトを示しました。これは、郡レベルのSARS-CoV-2感染リスクが、州内の郡と比較してMSA内の米国の郡でより大きな均一性を示したことを示しています. 地域固有のモデルのパラメーター化は、2020 年 5 月 21 日より前に記録された累積 COVID-19 症例が 200 人を超え、いずれかの地域で SARS-CoV-2 感染の新規症例が 5 件以上ある米国 MSA の SARS-CoV-2 サーベイランス データと一致することが判明しました。 2020 年 1 月 21 日から 2020 年 6 月 21 日までの期間の特定説(推定)の日。280 の米国 MSA が基準を満たしました。

全体として、調査結果は、SARS-CoV-2 の伝染性が米国の都市部全体で 4 倍の範囲にわたって異なることを示しました。 いくつかの都市地域は他の地域よりも急速なSARS-CoV-2伝染に対してはるかに高い感受性があることが判明したため、調査結果は肺疾患の将来の発生を緩和するのに役立つ可能性があります。

*重要なお知らせ

medRxiv は、査読されていない暫定的な科学レポートを公開しているため、決定的なものと見なしたり、臨床診療/健康関連の行動をガイドしたり、確立された情報として扱ったりするべきではありません。



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